Bem vindo a esse vício chamado Ragnarök Online que não deixa a gente em paz, hehe.
Garrafas Vazias não tem mais saída porque agora é possível comprar em NPC (na instância Torneio de Magia). Magma está assim há eras, e não vejo mudanças tão cedo. Hoje em dia a maneira mais usada para fazer dinheiro é fazer instâncias diariamente (Maldição de Glast Heim ,Fábrica do Terror, Ilha Bios, Caverna de Mors, Templo do Demônio Rei), mas isso você só terá acesso depois.
Uma dica que dou para todo mundo desde que jogo esse jogo: pegue TODOS os loots enquanto estiver upando. Tudo mesmo, até aquelas "porcarias" que parecem não ter valor nenhum. Depois pesquise quais deles podem ser usados em quests (use o browiki para pesquisar as quests mais recentes e as que dão acesso a mapas de up), com esses dá para fazer um dinheiro legal. Você não imagina o tanto de Erva Verde que eu vendi uns tempos atrás, e nem sabia porque tinha tanta demanda por isso, até lembrar que são usadas na quest de acesso ao Monastério Maldito. Esses loots podem até demorar um pouco para vender, mas saem. Lucrar em cima da preguiça sempre funciona. Não precisa vender baratinho, mas também não exagere na facada.
Depois que fizer um dinheiro você pode tentar revendas. Disso não entendo nada e nem gosto, mas tem gente que faz fortunas. Li em algum lugar que dá para começar com 50kk.
Como você mencionou, ROPs são uma maneira muito rápida de ganhar zeny, especialmente em época de ticket. Se recorrer a isso lembre-se de não vender barato, porque o que mais tem é espertinho querendo que você faça "caridade".